Protein–RNA interactions for Protein: Q12462

PEX11, Peroxisomal membrane protein PMP27, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX11Q12462 YDR018CYDR018C 1191 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 FYV4YHR059W 393 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YHC1YLR298C 696 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 HRI1YLR301W 735 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YML084WYML084W 309 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 LYS9YNR050C 1341 nt1.58□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 AIM6YDL237W 1173 nt1.57□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YGL177WYGL177W 348 nt1.57□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YHR210CYHR210C 1026 nt1.57□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 ECI1YLR284C 843 nt1.57□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 GIM3YNL153C 390 nt1.57□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 NCB2YDR397C 441 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 CTK2YJL006C 972 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 CAT8YMR280C 4302 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 LRE1YCL051W 1752 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 PES4YFR023W 1836 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 BRR2YER172C 6492 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 CDC60YPL160W 3273 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 NPR1YNL183C 2373 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 NIC96YFR002W 2520 nt1.56□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 HCS1YKL017C 2052 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 LHS1YKL073W 2646 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 PLP1YDR183W 693 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YJR071WYJR071W 369 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 ATG38YLR211C 681 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YIP3YNL044W 531 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YNL171CYNL171C 369 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 CDC31YOR257W 486 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 SRL4YPL033C 846 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YPR177CYPR177C 372 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 ARR2YPR200C 393 nt1.55□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 PKH3YDR466W 2697 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 VPS15YBR097W 4365 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 TRZ1YKR079C 2517 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 CAP1YKL007W 807 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YPT52YKR014C 705 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 ESC2YDR363W 1371 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 MYO4YAL029C 4416 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 PSO2YMR137C 1986 nt1.54□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 SBE22YHR103W 2559 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 COG7YGL005C 840 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YIL102CYIL102C 306 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YJL147CYJL147C 1149 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 PFD1YJL179W 330 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 CCE1YKL011C 1062 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YLR053CYLR053C 327 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 TOA1YOR194C 861 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 YOR333CYOR333C 417 nt1.53□□□□□ -2.16
PEX11Q12462 CTF4YPR135W 2784 nt1.53□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 DAL5YJR152W 1632 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 snR83snR83 306 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 ATP17YDR377W 306 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YER091C-AYER091C-A 222 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 CSE4YKL049C 690 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 FAR3YMR052W 615 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 RRT16YNL105W 429 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 MNE1YOR350C 1992 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 UTP21YLR409C 2820 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.52□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 TBS1YBR150C 3285 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 MES1YGR264C 2256 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 ADR1YDR216W 3972 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 RPL37BYDR500C 267 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 RPL16BYNL069C 597 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 SAR1YPL218W 573 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 MEC1YBR136W 7107 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 SRP1YNL189W 1629 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YJL070CYJL070C 2667 nt1.51□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 CHS1YNL192W 3396 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 HSE1YHL002W 1359 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 AIM23YJL131C 1071 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 SHE2YKL130C 741 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 IZH4YOL101C 939 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 BAG7YOR134W 1230 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 snR34snR34 203 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 ICS2YBR157C 768 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 ECM5YMR176W 4236 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 CDC53YDL132W 2448 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YBP2YGL060W 1926 nt1.5□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 DOT6YER088C 2013 nt1.49□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 HSL1YKL101W 4557 nt1.49□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YFR056CYFR056C 369 nt1.49□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YJL032WYJL032W 315 nt1.49□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 CSI2YOL007C 1026 nt1.49□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 ATX2YOR079C 942 nt1.49□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 VPS35YJL154C 2835 nt1.48□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 SOK2YMR016C 2358 nt1.48□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 SYH1YPL105C 2550 nt1.48□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YOL024WYOL024W 519 nt1.48□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YBR013CYBR013C 390 nt1.48□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 YPL238CYPL238C 390 nt1.48□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 GNT1YOR320C 1476 nt1.48□□□□□ -2.17
PEX11Q12462 GRR1YJR090C 3456 nt1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8 ms