Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC15Q0P6D6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC15Q0P6D6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms