Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSRP1Q08945 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSRP1Q08945 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms