Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPOCK1Q08629 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms