Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LOXL1Q08397 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms