Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LRP1Q07954 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LRP1Q07954 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms