Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RPL18Q07020 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RPL18Q07020 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms