Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FMODQ06828 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FMODQ06828 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FMODQ06828 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FMODQ06828 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms