Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CALD1Q05682 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms