Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTPN12Q05209 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN12Q05209 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms