Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ATP7AQ04656 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ATP7AQ04656 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms