Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GBE1Q04446 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GBE1Q04446 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms