Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PRB3Q04118 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRB3Q04118 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms