Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPCQ03188 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPCQ03188 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms