Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TGFBR3Q03167 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TGFBR3Q03167 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms