Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CAV1Q03135 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CAV1Q03135 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms