Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPL6Q02878 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms