Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DSC2Q02487 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DSC2Q02487 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms