Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
APBA1Q02410 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APBA1Q02410 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms