Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN2Q02246 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms