Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MDM2Q00987 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MDM2Q00987 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms