Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CACNA1BQ00975 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNA1BQ00975 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms