Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK5Q00535 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5Q00535 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms