Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HOXC5Q00444 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC5Q00444 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms