Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDLBPQ00341 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDLBPQ00341 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms