Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFAMQ00059 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms