Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HOXA4Q00056 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms