Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FAM3AP98173 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FAM3AP98173 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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FAM3AP98173 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3AP98173 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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FAM3AP98173 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3AP98173 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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