Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COG7P83436 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG7P83436 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG7P83436 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COG7P83436 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG7P83436 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG7P83436 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG7P83436 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG7P83436 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG7P83436 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COG7P83436 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG7P83436 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
COG7P83436 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COG7P83436 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms