Protein–RNA interactions for Protein: P82673

MRPS35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P82673 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MRPS35P82673 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPS35P82673 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPS35P82673 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MRPS35P82673 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPS35P82673 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPS35P82673 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPS35P82673 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MRPS35P82673 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms