Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP2P81877 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms