Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PITX1P78337 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PITX1P78337 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PITX1P78337 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PITX1P78337 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PITX1P78337 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PITX1P78337 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PITX1P78337 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PITX1P78337 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PITX1P78337 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms