Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM193AP78312 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM193AP78312 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms