Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HERVK_113P63132 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms