Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARF6P62330 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARF6P62330 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARF6P62330 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms