Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-21P61565 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms