Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ABCE1P61221 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ABCE1P61221 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms