Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRP6P59044 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP6P59044 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP6P59044 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP6P59044 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP6P59044 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP6P59044 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRP6P59044 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms