Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL3P58872 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL3P58872 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms