Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBASH3AP57075 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBASH3AP57075 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms