Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NAP1L1P55209 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms