Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCKAP1LP55160 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms