Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EMP1P54849 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EMP1P54849 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EMP1P54849 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EMP1P54849 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EMP1P54849 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EMP1P54849 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EMP1P54849 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EMP1P54849 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms