Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COPAP53621 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPAP53621 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPAP53621 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPAP53621 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPAP53621 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPAP53621 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPAP53621 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPAP53621 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPAP53621 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPAP53621 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPAP53621 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPAP53621 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPAP53621 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPAP53621 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPAP53621 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPAP53621 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COPAP53621 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms