Protein–RNA interactions for Protein: P52943

CRIP2, Cysteine-rich protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP2P52943 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CRIP2P52943 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRIP2P52943 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms