Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PGDP52209 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PGDP52209 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PGDP52209 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PGDP52209 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PGDP52209 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PGDP52209 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PGDP52209 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PGDP52209 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PGDP52209 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms