Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCNKBP51801 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLCNKBP51801 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms