Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
SMARCA4P51532 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SMARCA4P51532 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SMARCA4P51532 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms