Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CRIP1P50238 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CRIP1P50238 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms