Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPFP49454 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPFP49454 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPFP49454 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPFP49454 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPFP49454 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPFP49454 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPFP49454 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPFP49454 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms